Eine Funktion für Masterseiten in diesem Sinne hat FlexiPDF nicht.
Aber um beispielsweise ein Logo auf jeder Seite an der gleichen Stelle erscheinen zu lassen, kann man den Befehl "Seitenübergreifend kopieren" verwenden.
Das gewünschte Objekt markieren, es erscheint ganz rechts eine zusätzliche Ribbonkarte "Format". Hier in der Befehlsgruppe "Objekte" den oben genannten Befehl aufrufen.
Mehr Informationen dazu gibt es in der Online Hilfe
Objekte seitenübergreifend kopieren